dcsimg
Image of Thermus aquaticus

Deinococcus-thermus

Deinococcus-Thermus ( Galician )

provided by wikipedia gl Galician

O grupo Deinococcus-Thermus é un pequeno grupo de bacterias considerado un filo, que son moi resistentes ás condicións ambientais desfavorables.[1]

Comprende dous grandes grupos:

Aínda que estes grupos evolucionaron a partir dun devanceiro común, os dous mecanismos de resistencia que presentan desenvolvéronos de xeito independente.[3]

Estas bacterias teñen paredes celulares grosas que fan que teñan un patrón de tinguidura grampositivo, pero teñen unha segunda membrana, polo que en estrutura están próximos ás bacterias gramnegativas.

Cavalier-Smith deulle a este clado o nome de Hadobacteria[4] (de Hades, o inframundo dos antigos gregos).

Filoxenia

Véxase tamén: Taxonomía bacteriana.

O cladograma mostra a toxonomía actualmente aceptada do grupo baseada na LPSN (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature) [5] e do NCBI (National Center for Biotechnology Information) [6] e a filoxenia está baseada en datos do ARNr 16S do LTP 106 do proxecto The All-Species Living Tree.[7]

Thermaceae

?Rhabdothermus arcticus Steinsbu et al. 2011

   

Vulcanithermus mediatlanticus Miroshnichenko et al. 2003

    Oceanithermus

O. desulfurans Mori et al. 2004

   

O. profundus Miroshnichenko et al. 2003

       

Marinithermus hydrothermalis Sako et al. 2003

    Meiothermus

?M. granaticius Albuquerque et al. 2010

   

?M. rosaceusChen et al. 2002

   

M. silvanus (Tenreiro et al. 1995) Nobre et al. 1996

       

M. chliarophilus (Tenreiro et al. 1995) Nobre et al. 1996

   

M. timidus Pires et al. 2005

       

M. rufus Albuquerque et al. 2010

     

M. cerbereus Chung et al. 1997

     

M. ruber (Loginova et al. 1984) Nobre et al. 1996

     

M. cateniformans Zhang et al. 2010

   

M. taiwanensis Chen et al. 2002

              Thermus

?T. caldophilusTaguchi et al. 1983

   

?T. eggertssoniiPeters 2008

   

?T. filiformis Hudson et al. 1987

   

?T. kawarayensisKurosawa et al. 2005

   

?T. murrietaBenner et al. 2006

   

?T. nonproteolyticus

   

?T. rehaiLin et al. 2002

   

?T. yunnanensisGong et al. 2005

   

T. oshimai Williams et al. 1996

     

T. thermophilus (ex Oshima and Imahori 1974) Manaia et al. 1995

     

T. aquaticus Brock and Freeze 1969

       

T. arciformis Zhang et al. 2010

   

T. islandicus Bjornsdottir et al. 2009

         

T. brockianus Williams et al. 1995

   

T. igniterrae Chung et al. 2000

       

T. antranikianii Chung et al. 2000

   

T. scotoductus Kristjansson et al. 1994

                      Deinococcales

Truepera radiovictrix Albuquerque et al. 2005

Deinococcaceae    

Deinococcus pimensis Rainey and da Costa 2005

     

Deinococcus peraridilitoris Rainey et al. 2007

     

Deinococcus papagonensis Rainey and da Costa 2005

   

Deinococcus yavapaiensis Rainey and da Costa 2005

           

Deinobacterium chartae Ekman et al. 2011

Deinococcus

?D. aquivivusKaempferet al. 2008

   

?D. daejeonensis Srinivasan et al. 2012

   

?D. depolymerans Asker et al. 2011

   

?D. reticulitermitis Chen et al. 2012

   

?D. soliZhang et al. 2011

   

?D. xibeiensis Wang et al. 2010

     

D. misasensis Asker et al. 2008

     

D. cellulosilyticus Weon et al. 2007

   

D. roseus Asker et al. 2008

         

D. maricopensis Rainey e da Costa 2005

     

D. alpinitundrae Callegan et al. 2008

       

D. gobiensis Yuan et al. 2009

     

D. radiophilus (ex Lewis 1973) Brooks e Murray 1981

     

D. piscis Shashidhar e Bandekar 2009

   

D. proteolyticus Brooks e Murray 1981

             

D. sonorensis Rainey e da Costa 2005

     

D. radiomollis Callegan et al. 2008

     

D. altitudinis Callegan et al. 2008

     

D. aquiradiocola Asker et al. 2009

   

D. claudionis Callegan et al. 2008

                 

D. indicus Suresh et al. 2004

     

D. radiodurans (ex Raj et al. 1960) Brooks and Murray 1981

   

D. wulumuqiensis Wang et al. 2010

           

D. aquaticus Im et al. 2008

   

D. caeni Im et al. 2008

       

D. grandis (Oyaizu et al. 1987) Rainey et al. 1997

       

D. deserti de Groot et al. 2005

     

D. navajonensis Rainey e da Costa 2005

   

D. hohokamensis Rainey e da Costa 2005

         

D. ficus Lai et al. 2006 emend. Kämpfer 2009

     

D. aquatilis Kämpfer et al. 2008

   

D. yunweiensis Zhang et al. 2007

                 

D. xinjiangensis Peng et al. 2009

     

D. hopiensis Rainey e da Costa 2005

       

D. murrayi Ferreira et al. 1997

     

D. geothermalis Ferreira et al. 1997

     

D. apachensis Rainey e da Costa 2005

     

D. aerius Yang et al. 2009

   

D. aetherius Yang et al. 2010

             

D. aerophilus Yoo et al. 2010

     

D. aerolatus Yoo et al. 2010

     

D. radiopugnans Brooks and Murray 1981

     

D. marmoris Hirsch et al. 2006

     

D. saxicola Hirsch et al. 2006

   

D. frigens Hirsch et al. 2006

                                   

Nota:
♠ Cepas atopadas no NCBI pero non na LPSN.

Xenomas secuenciados

Actualmente hai dez xenomas secuenciados de estirpes (strains) deste filo.[8]

  • Deinococcus radiodurans R1
  • Thermus thermophilus HB27
  • Thermus thermophilus HB8
  • Deinococcus geothermalis DSM 11300
  • Deinococcus deserti VCD115
  • Meiothermus ruber DSM 1279
  • Meiothermus silvanus DSM 9946
  • Truepera radiovictrix DSM 17093
  • Oceanithermus profundus DSM 14977

As dúas Meiothermus sp. foron secuenciadas baixo os auspicios do proxecto Genomic Encyclopedia of Bacteria and Archaea (GEBA), que ten como obxectivo secuenciar organismos baseándose na súa importancia ou novidade filoxenética e non na súa patoxenicidade ou notoriedade.[9] Actualmente, o xenoma de Thermus aquaticus Y51MC23 está nas fases finais de completar a súa secuenciación no DOE Joint Genome Institute.[10]

Notas

  1. Griffiths E, Gupta RS (2007). "Identification of signature proteins that are distinctive of the Deinococcus-Thermus phylum" (PDF). Int. Microbiol. 10 (3): 201–8. PMID 18076002.
  2. "Copia arquivada". Arquivado dende o orixinal o 13 de xuño de 2011. Consultado o 04 de xullo de 2012.
  3. Omelchenko MV, Wolf YI, Gaidamakova EK; et al. (2005). "Comparative genomics of Thermus thermophilus and Deinococcus radiodurans: divergent routes of adaptation to thermophily and radiation resistance". BMC Evol. Biol. 5: 57. PMC 1274311. PMID 16242020. doi:10.1186/1471-2148-5-57.
  4. Cavalier-Smith T (2006). "Rooting the tree of life by transition analyses". Biol. Direct 1: 19. PMC 1586193. PMID 16834776. doi:10.1186/1745-6150-1-19.
  5. J.P. Euzéby. "Deinococcus-Thermus". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Arquivado dende o orixinal o 13 de xuño de 2011. Consultado o 4 xullo 2012.
  6. Sayers; et al. "Deinococcus-Thermus". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Consultado o 4 xullo 2012.
  7. 'The All-Species Living Tree' Project."16S rRNA-based LTP release 106 (full tree)" (PDF). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Consultado o 4 xullo 2012.
  8. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/MICROBES/microbial_taxtree.html
  9. Wu, D.; Hugenholtz, P.; Mavromatis, K.; Pukall, R. �D.; Dalin, E.; Ivanova, N. N.; Kunin, V.; Goodwin, L. et al. (2009). "A phylogeny-driven genomic encyclopaedia of Bacteria and Archaea". Nature 462 (7276): 1056–1060. Bibcode 2009Natur.462.1056W. DOI:10.1038/nature08656. PMC 3073058. PMID 20033048. [1].
  10. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomeprj/55053
license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autores e editores de Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia gl Galician

Deinococcus-Thermus: Brief Summary ( Galician )

provided by wikipedia gl Galician

O grupo Deinococcus-Thermus é un pequeno grupo de bacterias considerado un filo, que son moi resistentes ás condicións ambientais desfavorables.

Comprende dous grandes grupos:

As Deinococcales, que inclúe dúas familias e dous xéneros principais: Deinococcus e Truepera. O primeiro ten varias especies resistentes á radiación, que poden captar os residuos nucleares e outros materiais tóxicos sen sufriren dano, e sobreviven tamén no baleiro do espazo exterior ou en condicións extremas de calor ou frío. As Thermales inclúen varios xéneros resistentes á calor (Marinithermus, Meiothermus, Oceanithermus, Thermus, Vulcanithermus). A especie Thermus aquaticus, que vive en fontes hidrotermais, foi importante no desenvolvemento da técnica da Reacción en Cadea da Polimerase (PCR), xa que posúe un encima ADN polimerase termoestable (a Taq polimerase), que resiste as temperaturas necesarias para aplicar a técnica da PCR.

Aínda que estes grupos evolucionaron a partir dun devanceiro común, os dous mecanismos de resistencia que presentan desenvolvéronos de xeito independente.

Estas bacterias teñen paredes celulares grosas que fan que teñan un patrón de tinguidura grampositivo, pero teñen unha segunda membrana, polo que en estrutura están próximos ás bacterias gramnegativas.

Cavalier-Smith deulle a este clado o nome de Hadobacteria (de Hades, o inframundo dos antigos gregos).

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autores e editores de Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia gl Galician