Мясо и яйца многих трёхкоготных черепах охотно употребляются в пищу местным населением или идут на экспорт в другие страны. Китайского трионикса для этих целей в Азии специально разводят в прудах и интродуцировали на Гавайские и некоторые другие океанические острова.
Некоторые виды трёхкоготных черепах играют определённую роль в культуре местных жителей и считаются священными животными (например, тёмный трионикс). Китайские триониксы изображались на эфесах катан (самурайских мечей), возможно, из-за готовности этих агрессивных черепах к обороне.
Все виды семейства нуждаются в охране. К снижению численности приводит разрушение местообитаний и неконтролируемый отлов черепах.
В Красную книгу МСОП включён один вид — тёмный трионикс (Nilssonia nigricans). В Приложение I Конвенции о международной торговле видами (CITES) внесены четыре вида: гангский трионикс (Aspideretes gangeticus), глазчатый трионикс (A. hurum), чёрный трионикс (Apalone ater) и тёмный трионикс (Nilssonia nigricans). В Приложение II включены индийская лопастная черепаха (Lissemys punctata), большая мягкотелая черепаха (Pelochelys bibroni), узкоголовые черепахи (Chitra). В Приложение III включён африканский трионикс (Trionyx triunguis). Дальневосточная черепаха (Pelodiscus sinensis) занесена в Красную книгу РФ.
Древнейшие Trionychidae известны из раннего мела Азии. Sinaspideretes wimani из поздней юры Китая, иногда рассматриваемый как древнейший представитель трионихид, возможно, относится к двухкоготным черепахам Carettochelyidae. В позднем мелу трёхкоготные черепахи проникли в Северную Америку, а начиная с палеоцена распространились более широко. Они неизвестны в Антарктике, однако их ископаемые остатки были найдены в Южной Америке (плиоцен Венесуэлы), Австралии (верхний кайнозой, вероятно, миоцен) и Европе, где эти черепахи отсутствуют сегодня. В Европе Trionychidae существовали с палеоцена до плиоцена, а в Италии, возможно, дожили до нижнего плейстоцена.
Обильные находки позднемеловых и кайнозойских трёхкоготных черепах были найдены в Азии.
Trionychidae делятся на 3 подсемейства: Cyclanorbinae, Plastomeninae и Trionychinae. Лопастные черепахи (Cyclanorbinae) известны из нижнего миоцена Саудовской Аравии, плиоцена Африки и Индии, сегодня обитают в Африке к югу от Сахары, на Индийском субконтиненте и в Бирме (Мьянме). Черепахи из этого подсемейства характеризуются очень массивным окостеневшим карапаксом, слитыми гио- и гипопластроном и прикрывающими задние конечности и хвост клапанами в задней части пластрона, которые, вместе с подвижной передней частью пластрона, делают возможным замыкание панциря. Вымершее подсемейство Plastomeninae известно в Северной Америке с верхнего мела до палеоцена. По мнению В. М. Чхиквадзе, к Plastomeninae принадлежат находки из палеогена Казахстана. Пластрон представителей этого подсемейства полностью окостеневший, а неокостеневшее поле в середине пластрона мало или отсутствует. В третье подсемейство собственно трёхкоготных черепах (Trionychinae) включены все остальные виды семейства, у которых костные элементы пластрона слабо связаны между собой.
Amyda cartilaginea
Apalone ferox
Apalone spinefera
Chitra indica
Dogania subplana
Lissemys punctata
Nilssonia gangetica
Nilssonia nigricans
Pelochelys cantorii
Pelodiscus sinensis
Rafetus euphraticus
Rafetus swinhoei
Trionyx triunguis
